由于非洲足协（CAF）频繁卷入了重大的管理丑闻，FIFA预计将接管非洲足球的管理工作。
本周三，非洲足协决定放弃对该组织的管理权，目前正与FIFA进行协商，计划由FIFA首位女秘书长法蒂玛·萨穆拉（Fatma Samoura）担任非洲事务高级官员。若提议获得批准，萨穆拉将从8月1日起至少负责接管6个月，在担任FIFA秘书长之前她曾担任塞内加尔外交官和联合国多项事务的非洲主管。
据路透社消息，在一份泄露的内部文件中提到，萨穆拉将领导一支国际足联团队，对非洲足协的治理进行全面审查，监督该组织的运营管理，并在需要的地方提出一系列改革建议。其目的是为了将非洲足协建立在现代和健康的基础上，提高改善其形象和声誉。
这一提议由备受争议的非洲足协主席艾哈迈德·艾哈迈德（Ahmad Ahmad）提出的，目前艾哈迈德由于受到腐败和性侵指控正在接受国际足联道德委员会的调查。对于所有指控，他均表示否认。
在非洲杯拉开序幕前，非洲足协因非洲冠军联赛中的“重赛”判罚饱受争议。在突尼斯希望与卡萨布兰卡维达德的次回合比赛中主裁判拒绝观看争议进球的VAR，执意判罚该进球无效。此举引起维达德队球员强烈不满，在多次抗议无果后维达德队在次回合选择退赛。突尼斯希望队不战而胜，夺得了本赛季非洲冠军联赛的冠军。然而非洲足联于6月6日凌晨突然发布一则声明，要求突尼斯希望队退还冠军奖杯，双方将在中立场地进行重赛。
此外，非洲足协对于2019年、2021年和2023年非洲国家杯的重新安排也存在争议。在喀麦隆被取消主办权后，2019年非洲杯转由埃及主办，喀麦隆则负责举办2021年非洲杯，科特迪瓦将被迫让位，改为2023年举办世界杯。
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